1999-2005 гг. Московская Медицинская Академия им. И.М. Сеченова лечебный факультет, Москва

2005-2007 гг. Московская Медицинская Академия им. И.М. Сеченова кафедра госпитальной хирургии №2, клиническая ординатура  по специальности «хирургия», Москва.

2008-2011 гг. Московская Медицинская Академия им. И.М. Сеченова (с 2010г Первый Московский Государственный Медицинский Университет им. И.М. Сеченова кафедра госпитальной хирургии №2, очная аспирантура по специальности «хирургия», Москва.

2010-2012 гг. Первого Московского Государственного Медицинского Университета им. И.М. преподавал на кафедре госпитальной хирургии №2,  Сеченова по специальности «хирургия»

2012-2018 гг. Нагиев Э.Ш. работает в Национальном центре онкологии Минздрава Азербайджанской Республики в качестве хирурга-онколога

2018-по настоящее время в отделении Онко-колопроктологии Национального Центра Онкологии Минздрава Азербайджанской Республики. Спектром деятельности доктора Нагиева Э.Ш. является хирургические вмешательства при онкологических заболеваний толстой и прямой кишки

В 2012 году удачно защищена диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук на тему «Выбор способа операции при осложненных гигантских пилородуоденальных язвах».

Опубликовано свыше 10 научных работ.

Основная практическая деятельность связана с хирургическим лечением доброкачественных и злокачественных опухолей ЖКТ.